2021-12-27 21:46:04|已浏览：5096次
一、摘要：
褪黑素，作为一种内源性激素，在肿瘤中发挥着重要的作用。除了在调节昼夜节律，睡眠和神经内分泌之外，褪黑素在多个生存相关通路发挥功能。然而，肿瘤中褪黑素调控机制尚不清楚。作者在33个癌症中对褪黑素调控子进行了综合表征。通过基因组，转录组，蛋白组，表观组学数据联合非编码RNA和药物基因组数据揭示了褪黑素调控子的基因组改变和临床特征，识别了潜在靶向褪黑素调控子的药物。为肿瘤临床治疗提供了一种新的可能。
二、材料方法：
GTEx正常组织表达数据；TCGA mRNA/miRNA, methylation, SNV, CNV, clinical数据；TCPA蛋白数据；GDSC药物敏感性数据
Pathway score；network；subtype
三、结果：
1.褪黑素调控子基因集表达和亚型分析
2.褪黑素调控子体细胞突变
3.褪黑素调控子拷贝数变异
4.褪黑素调控子甲基化分析
5.miRNA调控分析
6.通路活性分析
7.药物敏感性分析
总结：
文章主要基于TCGA 33个癌症的数据，从表达、突变、甲基化、miRNA、蛋白和药物敏感性层面，对褪黑素调控子进行了系统刻画和分析，最终构成了这篇13分的研究。有两个点值得思考，一是纯生信的文章有难度但是也有潜力；二是，分析一个基因集合也没有那么不堪。总体上还是不难的，毕竟没有特别复杂的算法，结合具有研究价值的基因set，例如前段时间的吞噬作用调控子，相信水平不会低。
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